Участник:Tiy

Материал из MachineLearning.

Перейти к: навигация, поиск

Содержание

Кратко

Торшин Иван Юрьевич (р. 1972), к.ф.-м.н., к.х.н., доцент МФТИ. 165 публикаций в реферируемых журналах по информатике, прикладной математике, химии, медицине, биофизике и биологии; 3 монографии в серии “Bioinformatics in Post-genomic Era» (Nova Biomedical Publishers, NY, 2006-2009).

Список научных интересов

  • "Метрические" и "бинарные" подходы к постановке и решению плохо-формализованных задач
  • Порождение проблемно-ориентированных метрик и анализ метрических конфигураций
  • Комбинаторная теория разрешимости
  • Теория классификации значений признаков
  • Теория графов и её комбинаторные приложения в хемоинформатике
  • Анализ данных биомедицинских исследований
  • Комплекс задач из области биоинформатики

Примеры задач, которые могут быть предложен в качестве бакалаврской/магистерской работы

  • «Размывание» корреляций по уровням иерархии биологических систем
  • Общая теория алгоритмов выравнивания символьных последовательностей
  • Распознавание гена (распознавание промотеров, распознавание сайтов сплайсинга,распознавание экзонов)
  • 1D→3D: задача распознавания класса пространственной структуры белка
  • 1D→Ф — задача аннотации генома
  • Формула→3Dл
  • Сравнение химических формул
  • "Циклический" отбор признаков в генетических ассоциациях
  • Концептуализация абстрактов публикаций с использованием онтологий терминов

"Цели" и "идеи" этих и других задач объясняются в курсе лекций по биоинформатике

Ссылка на программу курса лекций

Биоинформатика_и_задачи_распознавания_в_современной_биологии_(курс_лекций,_И.Ю._Торшин)

Публикации

По целям и задачам современной биоинформатики:

  1. Torshin I.Yu. Sensing the change from molecular genetics to personalized medicine. Nova Biomedical Books, NY, USA, 2009, In “Bioinformatics in the Post-Genomic Era” series, ISBN 1-60692-217-0.
  2. Torshin I.Yu. Bioinformatics in the post-genomic era: physiology and medicine. Nova Biomedical Books, NY, USA (2007), ISBN 1-60021-752-4.
  3. Torshin I.Yu. Bioinformatics in the Post-Genomic Era: The Role of Biophysics, 2006, Nova Biomedical Books, NY, ISBN 1-60021-048-1.
Личные инструменты