Участник:EvgSokolov/Песочница
Материал из MachineLearning.
fRMA (Frozen Robust Multi-Array Analysis)
Рассматривается следующая модель уровня экспрессии:
Здесь используются следующие обозначения:
— номер партии микрочипов
. Говорят, что два чипа принадлежат одной партии, если эксперименты с ними были проведены в одной лаборатории в одно и то же время.
— номер микрочипа
.
— номер набора проб
. Также через
мы будем обозначать номер гена, соответствующего
-му набору проб.
— номер пробы
.
— предобработанная (с вычтенным фоном и нормализованная) логарифмированная интенсивность пробы
из набора проб
микрочипа
из партии микрочипов
.
— экспрессия гена
на
-м микрочипе.
— коэффициент сродства пробы
гену
.
— величина, отвечающая за разницу интенсивностей между разными партиями проб.
— случайная ошибка с нулевым средним.