Участник:EvgSokolov/Песочница

Материал из MachineLearning.

< Участник:EvgSokolov

Версия от 15:17, 22 октября 2011; EvgSokolov (Обсуждение | вклад)

(разн.) ← Предыдущая | Текущая версия (разн.) | Следующая → (разн.)

Перейти к: навигация, поиск

fRMA (Frozen Robust Multi-Array Analysis)

Рассматривается следующая модель уровня экспрессии:

$Y_{ijkn} = \theta_{in} + \phi_{jn} + \gamma_{jkn} + \epsilon_{ijkn}$

Здесь используются следующие обозначения:

$k$ — номер партии микрочипов $k \in 1, \dots, K$ . Говорят, что два чипа принадлежат одной партии, если эксперименты с ними были проведены в одной лаборатории в одно и то же время.

$i$ — номер микрочипа $i \in 1, \dots, I_k$ .

$n$ — номер набора проб $n \in 1, \dots, N$ . Также через $n$ мы будем обозначать номер гена, соответствующего $n$ -му набору проб.

$j$ — номер пробы $i \in 1, \dots, J_n$ .

$Y_{ijkn}$ — предобработанная (с вычтенным фоном и нормализованная) логарифмированная интенсивность пробы $j$ из набора проб $n$ микрочипа $i$ из партии микрочипов $k$ .