Участник:Andrey Ryazanov

Материал из MachineLearning.

(Различия между версиями)
Перейти к: навигация, поиск
Строка 10: Строка 10:
= Отчет о научно-исследовательской работе =
= Отчет о научно-исследовательской работе =
-
 
-
== Задача обратного фолдинга белка ==
 
=== Весна 2016, 16-й семестр ===
=== Весна 2016, 16-й семестр ===
 +
'''Inverse Protein Folding Problem via Quadratic Prgramming''', Рязанов А. В., Карасиков М. Е., Грудинин С. В.
'''Inverse Protein Folding Problem via Quadratic Prgramming''', Рязанов А. В., Карасиков М. Е., Грудинин С. В.

Версия 10:54, 19 сентября 2016

Рязанов Андрей Владимирович

МФТИ, ФУПМ

Кафедра "Интеллектуальные системы"

Направление "Интеллектуальный анализ данных"

andrei.ryazanov@phystech.edu

Отчет о научно-исследовательской работе

Весна 2016, 16-й семестр

Inverse Protein Folding Problem via Quadratic Prgramming, Рязанов А. В., Карасиков М. Е., Грудинин С. В.

This paper presents a method of reconstruction a primary structure of a protein that folds into a given geometrical shape. This method predicts the primary structure of a protein and restores its linear sequence of amino acids in the polypeptide chain using the tertiary structure of a molecule. Unknown amino acids are determined according to the principle of energy minimization. This study represents inverse folding problem as a quadratic optimization problem and uses different relaxation techniques to reduce it to the problem of convex optimizations. Computational experiment compares the quality of these approaches on real protein structures.

Публикация:

Ryazanov A., Karasikov M., Grudinin S. Inverse Protein Folding Problem via Quadratic Programming, принята к публикации в сборнике трудов конференции ИТиС 2016.

Доклады:

Ryazanov A., Karasikov M., Grudinin S. Inverse Protein Folding Problem via Quadratic Programming, Традиционная молодежная Школа "Управления, информация и оптимизация".

Гранты:

РФФИ 16-37-00111

Личные инструменты