Численные методы обучения по прецедентам (практика, В.В. Стрижов)/Группа 774, осень 2010

Материал из MachineLearning.

(Различия между версиями)
Перейти к: навигация, поиск

Strijov (Обсуждение | вклад)
(Новая: Численные методы обучения по прецедентам ([[Численные методы обучения по прецедентам (практика, В.В. С...)
К следующему изменению →

Версия 15:51, 29 июня 2010

Численные методы обучения по прецедентам (программа курса) Автоматизация и стандартизация научных исследований (программа курса)

Задачи

Название задачи Работу выполняет Работу рецензируют Задачу предложил Результат
Прогнозирование класса третичной структуры белка по первичной (пример) И.Ю. Торшин


Предлагается использовать базу данных "ASTRAL SCOP Genetic Domain Sequences 1.75"[1], архив PDB SEQRES records: astral-scopdom-seqres-gd-all-1.75.fa[2]

Структура данных 

>d1dlya_ a.1.1.1 (A:) Protozoan/bacterial hemoglobin {Green alga (Chlamydomonas eugametos) [TaxId: 3054]}
slfaklggreaveaavdkfynkivadptvstyfsntdmkvqrskqfaflayalggasewk
gkdmrtahkdlvphlsdvhfqavarhlsdtltelgvppeditdamavvastrtevlnmpq
  • d1dlya_ -- идентификатор эксперимента (код файла в PDB),
  • a.1.1.1 -- классификатор белка, иерархическая структура разделена точками,
  • slfaklggreavea... -- последовательность аминокислот (без пробелов и переносов до символа >).


Экзамен

Пока не назначен

Источник — «http://machinelearning.ru/wiki/index.php?title=%D0%A7%D0%B8%D1%81%D0%BB%D0%B5%D0%BD%D0%BD%D1%8B%D0%B5_%D0%BC%D0%B5%D1%82%D0%BE%D0%B4%D1%8B_%D0%BE%D0%B1%D1%83%D1%87%D0%B5%D0%BD%D0%B8%D1%8F_%D0%BF%D0%BE_%D0%BF%D1%80%D0%B5%D1%86%D0%B5%D0%B4%D0%B5%D0%BD%D1%82%D0%B0%D0%BC_%28%D0%BF%D1%80%D0%B0%D0%BA%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0%2C_%D0%92.%D0%92._%D0%A1%D1%82%D1%80%D0%B8%D0%B6%D0%BE%D0%B2%29/%D0%93%D1%80%D1%83%D0%BF%D0%BF%D0%B0_774%2C_%D0%BE%D1%81%D0%B5%D0%BD%D1%8C_2010»
Личные инструменты