Численные методы обучения по прецедентам (практика, В.В. Стрижов)/Группа YАД, весна 2016

Материал из MachineLearning.

(Различия между версиями)
Перейти к: навигация, поиск
(Список проектов)
(Список проектов)
Строка 76: Строка 76:
4. Тематическая модель классификации для диагностики заболеваний по электрокардиограмме. Воронцов, Светлана Цыганова
4. Тематическая модель классификации для диагностики заболеваний по электрокардиограмме. Воронцов, Светлана Цыганова
-
 
-
7. Определение положения белков по электронной карте. Грудинин, Катруца
 
8. Классификация физической активности: исследование изменения пространства параметров при дообучении и модификации моделей глубокого обучения. Стрижов, Бахтеев
8. Классификация физической активности: исследование изменения пространства параметров при дообучении и модификации моделей глубокого обучения. Стрижов, Бахтеев
Строка 133: Строка 131:
* '''Новизна''': Тематические модели ранее не применялись для классификации дискретизированных биомедицинских сигналов.
* '''Новизна''': Тематические модели ранее не применялись для классификации дискретизированных биомедицинских сигналов.
* '''Консультант''': Светлана Цыганова, '''автор задачи''' К.В.Воронцов.
* '''Консультант''': Светлана Цыганова, '''автор задачи''' К.В.Воронцов.
-
 
-
=== Задача 7 ===
 
-
* '''Название''': определение положения белков по электронной карте
 
-
* '''Задача''': неформально --- есть наборы экспериментально определённых карт расположения белков в комплексах, часть из них известна в высоком разрешении, необходимо восстановить всю карту в высоком разрешении; формально --- есть матрицы и вектора энергий соответствующие каждой карте белкового комплекса, нужно определить какой набор белков минимизирует квадратичную форму, образованую матрицей и вектором.
 
-
* '''Данные''': экспериментальные данные с сайта http://www.emdatabank.org/ будуь преобразованы в матрицы в вектора энергий. Понимание биофизической природы не обязательно.
 
-
* '''Литература''': статьи по методам решения задач квадратичного программирования и различным релаксациям
 
-
* '''Базовой алгоритм''': методы квадратичного программирования с различными релаксациями
 
-
* '''Решение''': минимизация суммарной энергии белкового комплекса
 
-
* '''Новизна''': применение методов квадратичного программирования и исследование их точности в задачах восстановления электронных карт
 
-
* '''Консультант''': Александр Катруца, автор задачи: Сергей Грудинин.
 
-
* '''Желательные навыки''': понимание и интерес к методам оптимизации, работа с пакетом CVX
 
=== Задача 8 ===
=== Задача 8 ===

Версия 08:12, 18 февраля 2016


Моя первая научная статья

Участвуют эксперты, индивидуальные консультанты и студенты Кафедры анализа данных ФИВТ МФТИ.

Роли

Студент третьего курса очень хочет научиться ставить задачи формально, находить нужную литературу, порождать новые и актуальные идеи и решения задач.

Консультант помогает студенту в пользовании инструментами, отвечает на вопросы по специальности, консультирует выполнение работ, оперативно реагирует на проблемы, проверяет (в среду) результаты, ставит оценки. Предполагается, что консультант сам пишет работу-спутник по этой теме. В конце работы могут быть объединены или выполнены и опубликованы параллельно. По возможности, рекомендуется организовать правки текста студента с целью улучшить стиль изложения таким образом, чтобы студент вносил правки самостоятельно. Возможно, при очной встрече или по скайпу.

Эксперт: поставщик задачи, владелец данных, либо тот, кто гарантирует новизну и актуальность работы.

Результаты

Автор Тема научной работы Ссылка Консультант Рецензент Доклад Буквы Сумма Оценка Журнал
Гончаров Алексей (пример) Метрическая классификация временных рядов code,

paper, slides

Мария Попова Задаянчук Андрей BMF AILSBRCVTDSW 12 10 ИИП

Работа и консультации

  1. Работы сдаются в течение недели.
  2. Желательна итеративная сдача работ, начинать показ лучше в выходные.
  3. Дедлайн последней версии работы: среда 6:00am (проверка занимает всю среду).
  4. В отчет будет добавлен пункт об учете времени, затраченном на выполнение проекта по неделям.
  5. Каждый этап работ + 1 балл по системе (А--, А-, А, А+, А++). Несделанная работа — A0. Мотивированный перенос работы — знак «A>». Недельное опоздание — знак «-».

Задачи

Шаблон описания научной статьи

  • Название: Название, под которым статья подается в журнал.
  • Задача: Описание или постановка задачи. Желательна постановка в виде задачи оптимизации (в формате argmin). Также возможна ссылка на классическую постановку задачи.
  • Данные: Краткое описание данных, используемых в вычислительном эксперименте, и ссылка на выборку.
  • Литература: Список научных работ, дополненный 1) формулировкой решаемой задачи, 2) ссылками на новые результаты, 3) основной информацией об исследуемой проблеме.
  • Базовой алгоритм: Ссылка на алгоритм, с которым проводится сравнение или на ближайшую по теме работу.
  • Решение: Предлагаемое решение задачи и способы проведения исследования. Способы представления и визуализации данных и проведения анализа ошибок, анализа качества алгоритма.
  • Новизна: Обоснование новизны и значимости идей (для редколлегии и рецензентов журнала).


Список проектов

1. Синергия алгоритмов классификации. Данные из репозитория UCI, чтобы можно было сравнивать напрямую с другими работами, в частности работами Вапника. Адуенко

2. Темпоральная тематическая модель коллекции пресс-релизов. Воронцов

3. Согласование логических и линейных моделей классификации в информационном анализе электрокардиосигналов. Воронцов, Влада Целых

4. Тематическая модель классификации для диагностики заболеваний по электрокардиограмме. Воронцов, Светлана Цыганова

8. Классификация физической активности: исследование изменения пространства параметров при дообучении и модификации моделей глубокого обучения. Стрижов, Бахтеев

9. Восстановление первичной структуры белка по геометрии его главной цепи. Грудинин, Карасиков

11. Бэггинг нейронных сетей в задаче предсказания биологической активности ядерных рецепторов. Стрижов, Попова

13. Отбор мультикоррелирующих признаков в задаче векторной авторегрессии. Стрижов, Нейчев

15. Преобразования временных рядов для декодирование движения руки с помощью ECoG сигналов (electrocorticographic signals) у обезьян. Стрижов, Задаянчук

25. Устойчивость дискретизации электрокардиосигналов относительно частотной фильтрации

26. Построение отображений с минимальной деформацией для сравнения изображений с эталоном. Гаранжа Владимир Анатольевич

27. Кросс-язычный тематический поиск научных публикаций. Воронцов, Марина Суворова

Личные инструменты