Статистический анализ данных (курс лекций, К.В.Воронцов)/2010

Материал из MachineLearning.

(Различия между версиями)
Перейти к: навигация, поиск
м (Задание 2. Анализ реальных данных)
м (Эффективность тромболитической терапии)
Строка 131: Строка 131:
Собраны данные по 206 пациентам второго кардиологического отделения московской городской клинической больницы №25. Имеются результаты 14 анализов, а также 8 дополнительных признаков, описывающих пациента (пол, возраст, курение, наличие диабета и т.д.)
Собраны данные по 206 пациентам второго кардиологического отделения московской городской клинической больницы №25. Имеются результаты 14 анализов, а также 8 дополнительных признаков, описывающих пациента (пол, возраст, курение, наличие диабета и т.д.)
::Чиркова Алла: построить функцию, оценивающую вероятность выздоровления пациента в результате тромболитической терапии по приведённым 22 признакам.
::Чиркова Алла: построить функцию, оценивающую вероятность выздоровления пациента в результате тромболитической терапии по приведённым 22 признакам.
 +
::Дергунов Вадим: построить функцию, оценивающую вероятность возникновения осложнений у пациента в результате тромболитической терапии по приведённым 22 признакам.
= Ссылки =
= Ссылки =

Версия 15:06, 7 ноября 2010

Содержание

Задание 1. Исследование свойств одномерных статистических критериев на модельных данных

Необходимо провести исследование одного или нескольких классических критериев проверки статистических гипотез. Интерес представляет поведение достигаемого уровня значимости (p-value) как функции размера выборок и параметров распределения. В соответствии с индивидуальными параметрами задания необходимо указанным способом сгенерировать одну или несколько выборок из заданного распределения, выполнить проверку гипотезы при помощи соответствующего критерия, а затем многократно повторить эту процедуру для различных значений параметров. По результатам расчётов необходимо построить требуемые в задании графики, среди которых могут быть следующие:

  1. график зависимости достигаемого уровня значимости от значений параметров при однократном проведении эксперимента;
  2. график зависимости достигаемого уровня значимости от значений параметров, усреднённого по большому количеству повторений эксперимента (например, по 100, 500, 1000 повторений);
  3. график с эмпирическими оценками мощности критерия для разных значений параметров.

В качестве оценки мощности принимается доля отвержений нулевой гипотезы среди всех проверок. То есть, если эксперимент повторялся k раз для каждого набора значений параметра, и в m из k случаев гипотеза была отвергнута на некотором фиксированном уровне значимости \alpha (примем \alpha=0.05), оценкой мощности будет отношение m/k.

Необходимо сдать: выполненный в LaTex или Microsoft Word отчёт с описанием алгоритма, построенными графиками и выводами (объяснение полученных результатов моделирования, границы применимости критерия и т.д.), а также *.m-файл, при запуске которого на экран выводятся графики, соответствующие имеющимся в отчёте (допускается, хотя и не рекомендуется использование среды R).

Задание принимается до первого ноября.

Пример задания

Исследуем поведение классического двухвыборочного критерия Стьюдента для проверки гипотезы однородности против альтернативы сдвига при разных значениях параметров.

x^n = (x_1,\ldots,x_n)\sim N(\mu_1,\sigma),\;\; y^n = (y_1,\ldots,y_n)\sim N(\mu_2,\sigma);

H_0\,:\; \mu_1=\mu_2,

H_1\,:\; \mu_1\neq\mu_2.

\sigma = 1; \;\;\; \mu_1=0; \;\;\; \mu_2=0\,:\,0.05\,:\,3; \;\;\;  n=5\,:\,1\,:\,50.

При каждом значении \mu_2 выборки для разных значений n генерируются независимо.

Задания

Анализ устойчивости критериев к нарушению предположений

  • Исследовать устойчивость одновыборочного критерия Стьюдента к нарушению предположения о нормальности данных. x^n — смесь распределений N(\mu,1) и U[-a+\mu,a+\mu] с весами p и 1-p соответственно (при генерации выборки используется случайный датчик — если его значение не превосходит p, то добавляем в выборку элемент, взятый из нормального распределения, иначе — элемент, взятый из равномерного). Для разных значений параметров выборки генерируются независимо.
    H_0\,:\; \mu=0, \;\; H_1\,:\; \mu\neq 0;
    p=0\,:\,0.02\,:\,1; \;\;  \mu=-1\,:\,0.05\,:\,1; \;\; n=100.
    Построить графики вида 1, 2, 3, сделать выводы о чувствительности критерия к зашумлению выборки.
Вишневский Валерий: a=1.
Гарсиа Анхела: a=5.
Дергунов Вадим: a=10.
  • Исследовать устойчивость двухвыборочного критерия Стьюдента для независимых выборок к нарушению предположения о нормальности данных. x^n \sim N(\mu_1,1), y^n — смесь распределений N(\mu_2,1) и U[-a+\mu_2,a+\mu_2] с весами p и 1-p соответственно (при генерации выборки используется случайный датчик — если его значение не превосходит p, то добавляем в выборку элемент, взятый из нормального распределения, иначе — элемент, взятый из равномерного). Для разных значений параметров выборки генерируются независимо.
    H_0\,:\; \mu_1=\mu_2, \;\; H_1\,:\; \mu_1\neq\mu_2;
    \mu_1=0; \;\; p=0\,:\,0.02\,:\,1; \;\;  \mu_2=-1\,:\,0.05\,:\,1; \;\; n=100.
    Построить графики вида 1, 2, 3, сделать выводы о чувствительности критерия к зашумлению одной из выборок.
Добров Григорий: a=1.
Дячкин Олег: a=5.
Ерошенко Александр: a=10.

Анализ чувствительности критериев к редактированию выборки

  • Известно, что исключение из выборки определённых наблюдений зачастую может достаточно сильно повлиять на результат анализа. Необходимо исследовать чувствительность одновыборочного критерия критерия Стьюдента к редактированию выборки.
    x^n \sim N(\mu,\sigma);
    H_0\,:\; \mu=0, \;\;\; H_1\,:\; \mu>0.
    При каждом значении параметра \mu генерируется выборка размера n, проводится проверка гипотезы H_0, затем по некоторому правилу из выборки исключается один из элементов, проверка гипотезы повторяется, затем исключается ещё один, и т.д. Обозначим за K максимальное число исключённых в таком процессе элементов. Построить графики вида 1, 2, 3, сделать выводы о чувствительности критерия к редактированию выборки.
Когадеева Мария: n=100;\;\;K=50;\;\;\sigma=1;\;\;\mu=-1\,:\,0.01\,:\,1;\;\; на каждом шаге исключается максимальный элемент.
Колесниченко Алексей: n=200;\;\;K=100;\;\;\sigma=5;\;\;\mu=-2\,:\,0.02\,:\,2;\;\; на каждом шаге исключается максимальный элемент.
Кошманова Наталья: n=100;\;\;K=50;\;\;\sigma=2;\;\;\mu=-2\,:\,0.02\,:\,2;\;\; на каждом шаге исключается минимальный элемент.
Лаптев Дмитрий: n=200;\;\;K=100;\;\;\sigma=5;\;\;\mu=-3\,:\,0.03\,:\,3;\;\; на каждом шаге исключается минимальный элемент.

Анализ поведения схожих критериев

Требуется исследовать поведение указанной пары статистических критериев, подходящих для решения одной и той же задачи, сравнить мощность и достигаемые уровни значимости и сделать выводы о границах применимости критериев. Необходимо для каждого из критериев построить графики зависимости достигаемых уровней значимости и оценок мощностей от параметров, и показать, в каких областях изменения параметров предпочтительнее использовать тот или иной критерий. Выбрать вид графиков так, чтобы различия между критериями были видны наиболее ясно (например, график вида 4).

  • x^n \sim N(0,1),\;\;y^n \sim N(\mu,1);
    H_0\,:\; \mu=0, \;\;\; H_1\,:\; \mu\neq 0;
    \mu=-2\,:\,0.02\,:\,2;\;\; n=10\,:\,5\,:\,100.
Логачев Юрий: двухвыборочный критерий Стьюдента для независимых выборок и критерий Уилкоксона-Манна-Уитни.
Полежаева Елена: двухвыборочный критерий Стьюдента для связных выборок и критерий Уилкоксона для связных выборок.
Прокашева Ольга: двухвыборочные критерий Стьюдента для связных и независимых выборок.
Пятков Евгений: критерий Уилкоксона-Манна-Уитни и медианный критерий.
Сизов Алексей: критерий Уилкоксона для связных выборок и критерий знаков.
Кожахметова Жанна: критерий знаков и медианный критерий.
  • x^n \sim Be(p_1),\;\;y^n \sim Be(p_2);
    a = \sum_{n}I\(x_i=1\),\;\;  b = \sum_{n}I\(x_i=0\),\;\; c = \sum_{n}I\(y_i=1\),\;\;  d = \sum_{n}I\(y_i=0\);
      H_0\,: связь между признаками в таблице сопряжённости 2×2, задаваемой величинами a, b, c, d, отсутствует; \;\;\; H_1\,: признаки связаны между собой.
Слепнева Екатерина: критерий хи-квадрат и точный критерий Фишера. p_1=0\,:\,0.02\,:\,1; \;\; p_2=0\,:\,0.02\,:\,1; \;\;n=50.
Тишин Кирилл: критерий хи-квадрат и точный критерий Фишера. p_1=0.5; \;\; p_2=0\,:\,0.05\,:\,1; \;\;n=10\,:\,2\,:\,50.
  • x^n  — смесь распределений N(0,1) и U[-a,a] с весами p и 1-p соответственно (при генерации выборки используется случайный датчик — если его значение не превосходит p, то добавляем в выборку элемент, взятый из нормального распределения, иначе — элемент, взятый из равномерного).
     H_0\,:\; x \sim N(0,1), \;\;\; H_1\,:\; H_0 неверна;
    p=0\,:\,0.02\,:\,1; \;\; n=10\,:\,5\,:\,100.
Чернышов Виктор: критерий Шапиро-Уилка и критерий Колмогорова-Смирнова. a=1.
Чиркова Алла: критерий омега-квадрат и критерий Шапиро-Уилка. a=2.
Шевцова Алена: критерий хи-квадрат и критерий омега-квадрат. a=5.
Щичко Антон: критерий Колмогорова-Смирнова и критерий хи-квадрат. a=7.

Задание 2. Анализ реальных данных

Ниже приведены описания анализируемых данных и постановки задач. Сами данные каждый студент может получить по электронной почте сразу после сдачи первого задания. При проведении анализа можно пользоваться любыми доступными программными средствами. Необходимо предоставить подробный письменный отчёт по проведённому исследованию, содержащий выводы и описания каждого этапа анализа — используемые методы, обоснование их применимости, промежуточные результаты вычислений, графики. Помимо выводов, касающихся математических особенностей решения, необходимо включить в отчёт заключения, сформулированные в терминах предметной области, которые могли бы быть понятны гипотетическому заказчику-нематематику.

Летальность пациентов с сепсисом

По 454 пациентам с сепсисом (лихорадка, тахикардия, тахипноэ и острая недостаточность по крайней мере одной системы органов) имеются следующие данные: оценка начального состояния по шкале APACHE острых и хронических функциональных изменений, факт наступления смерти в течение 30 дней после начала исследования (для каждого значения APACHE score приведены общее число пациентов в таком состоянии и соответствующее число пациентов, умерших в течение 30 дней).

Когадеева Мария: оценить вероятность наступления в 30-дневный срок летального исхода в зависимости от исходного состояния. Построить функции, дающие точечную оценку и границы 95% доверительного интервала.

Линейные размеры тысячефранковых банкнот

Банкнота в 1000 швейцарских франков серии, действовавшей в период с 1911 по 1958. Красным обозначены измеренные величины.
Банкнота в 1000 швейцарских франков серии, действовавшей в период с 1911 по 1958. Красным обозначены измеренные величины.

Имеются данные измерений двухсот швейцарских тысячефранковых банкнот, бывших в обращении в первой половине XX века. Сто из банкнот были настоящими, а сто - поддельными. Измерены следующие величины: X_1 — длина банкноты, X_2 —ширина банкноты с левой стороны, X_3 —ширина банкноты с правой стороны, X_4 —расстояние от нижнего края до рамки рисунка, X_5 — расстояние от нижнего края до рамки рисунка, X_6 — длина диагонали рисунка.

Логачев Юрий: построить функцию, оценивающую по данным измерений вероятность того, что имеющаяся банкнота фальшивая, и 95% доверительный интервал для этой вероятности.
Пятков Евгений: построить функции, оценивающие вероятность того, что имеющаяся банкнота фальшивая, по признакам X_1-X_3 и по признакам X_4-X_6. Сравнить эффективность выявления фальшивых купюр по двум группам признаков, сделать выводы.

Ценообразование бриллиантов

Имеются данные о цене и потребительских качествах 308 бриллиантов, продававшихся в Сингапуре в 2000 году. Известны: вес бриллианта в каратах, цвет (закодирован буквами латинского алфавита: наиболее чистый цвет — буквой D, менее чистые — буквами E, F, G и т.д., чем ближе к концу алфавита, тем "грязнее"), группа чистоты (отсутствие дефектов, профессиональная оценка, выдаваемая специалистами при исследовании бриллианта в лупу десятикратного увеличения; бриллианты без трещин и включений получают оценку IF ("internally flawless"), далее в порядке убывания чистоты следуют группы VVS1 и VVS2 ("very very slightly imperfect"), VS1 и VS2 ("very slightly imperfect")), название организации, выдавшей сертификат по группе чистоты (GIA — Gemmological Institute of America, IGI — International Gemmological Institute, HRD — Hoge Raad Voor Diamant), стоимость бриллианта в сингапурских долларах.

Полежаева Елена: построить модель ценообразования бриллиантов, учитывая все особенности имеющихся данных.
Кожахметова Жанна: отличается ли средняя цена бриллиантов, сертифицированных различными организациями?
Сизов Алексей: какой признак более значимо влияет на цену бриллиантов — цвет или чистота?
Прокашева Ольга: существует общепринятая система классификации бриллиантов на мелкие — до 0.29 карата, средние — от 0.30 до 0.99 карата и крупные — свыше 1 карата. Достаточно ли для предсказания цены знать о весе бриллианта только к какому классу он относится, или предсказания с использованием знаний о точном весе значимо лучше?

Счета за электроэнергию

Имеются помесячные данные о тратах на электроэнергию одного фиксированного домохозяйства на среднем западе США. За каждый месяц 1991-2000 годов приведены затраты на электроэнергию в долларах. Для объяснения колебаний размера счёта приведены следующие переменные: среднемесячная температура по данным последних тридцати лет, погодные индексы CDD и HDD (CDD - Cooling Degree Day - количество градусов, на которые средняя дневная температура больше 65°F, взятое суммой за все дни месяца; HDD - Heating Degree Day - аналогично, суммарное количество градусов, на которое средняя дневная температура меньше 65°F), число проживающих в доме членов семьи, индикатор установки нового счётчика, индикаторы установки двух новых тепловых насосов, объём потребления электроэнергии в киловатт-часах.

Гарсиа Анхела: предсказать объём потребления и затраты на электроэнергию в каждом месяце 2001 года.
Колесниченко Алексей: оценить влияние установки нового оборудования на объём потребления и затраты на электроэнергию.
Кошманова Наталья: построить функцию, предсказывающую затраты на электроэнергию по температуре, погодным индексам и числу проживающих в доме.

Кассовые сборы кинофильмов

Рассматриваются 428 фильмов с наибольшими кассовыми сборами в истории (по данным boxofficemojo.com). По каждому фильму известны: название, студия, на которой он был снят, суммарные кассовые сборы, сборы в США и в остальном мире по отдельности, год выхода, индикатор повторного выхода картины в прокат.

Тишин Кирилл: сравнить по всем подходящим признакам фильмы студий Warner Bros., Buena Vista, Universal, Fox, Paramount и Sony (в совокупности ими снято 324 фильма из рассматриваемых 428). Есть ли значимые отличия между продукцией этих студий по какому-либо из признаков?
Щичко Антон: построить функцию, оценивающую сборы фильма за пределами США, по сборам в США, названию студии, году выпуска и индикатору повторного выхода в прокат.
Лаптев Дмитрий: есть ли связь между сборами фильма и годом выхода на экраны? Использовав дополнительную информацию о среднегодовой цене билета, привести кассовые сборы рассматриваемых фильмов к ценам 2010 года. Оценить связь между преобразованными сборами фильма и годом выхода на экраны.

Нормальная температура тела

У 130 испытуемых были измерены температура тела и пульс, записаны также данные о поле испытуемых.

Ерошенко Александр: построить функцию для оценки температуры по пульсу и полу испытуемого.
Добров Григорий: построить функцию для оценки пульса по температуре тела и полу испытуемого.
Дячкин Олег: построить функцию, предсказывающую, какого пола испытуемый, на основе результатов измерений пульса и температуры, оценить надёжность такого предсказания.

Вкус воды

У 106 испытуемых, пришедших на праздник университета Лонгвуд, выяснили, какую воду они обычно пьют - бутилированную, фильтрованную или водопроводную. По каждому из опрошенных имеются также данные о поле, возрасте и предпочитаемой марке бутилированной воды, если такая есть. После опроса испытуемым предложили расставить в порядке ухудшения вкусовых качеств четыре образца воды - марок Fiji, Sam’s Choice, Aquafina и обычную водопроводную воду, причём ни сами испытуемые, ни опрашивающие не знали, какой образец какую воду содержит (двойной слепой тест).

Чернышов Виктор: исследовать распределение приоритетов по результатам двойного слепого теста, рассмотреть связь между результатами теста и заявленными предпочтениями.
Вишневский Валерий: отличаются ли мужчины и женщины по заявленным предпочтениям или результатам слепого теста?
Шевцова Алена: верно ли, что испытуемые, пьющие бутилированную воду, дают более низкие оценки водопроводной воде, чем все остальные? Верно ли, что те, кто пьёт фильтрованную воду, дают ей более низкие оценки, чем те, кто пьёт водопроводную?

Эффективность тромболитической терапии

Собраны данные по 206 пациентам второго кардиологического отделения московской городской клинической больницы №25. Имеются результаты 14 анализов, а также 8 дополнительных признаков, описывающих пациента (пол, возраст, курение, наличие диабета и т.д.)

Чиркова Алла: построить функцию, оценивающую вероятность выздоровления пациента в результате тромболитической терапии по приведённым 22 признакам.
Дергунов Вадим: построить функцию, оценивающую вероятность возникновения осложнений у пациента в результате тромболитической терапии по приведённым 22 признакам.

Ссылки

Личные инструменты